己二酸主要用作尼龍66和工程塑料的原料，也用于生產各種酯類產品，還用作聚氨基甲酸酯彈性體的原料，各種食品和飲料的酸化劑，其作用有時勝過檸檬酸和酒石酸。
己二酸也是醫(yī)藥、酵母提純、殺蟲劑、粘合劑、合成革、合成染料和香料的原料。
己二酸酸味柔和且持久，在較大的濃度范圍內pH值變化較小，是較好的pH值調節(jié)劑。GB2760-2007規(guī)定，本品固體飲料，其最大使用量是0.01g/kg；也可用于果凍和果凍粉，用于果凍的最大使用量為0.01g/kg；用于果凍粉時，可按沖調倍數(shù)增加使用量。
